ЭКСПЛУАТАЦИЯ НА ВОДЕМореходные качества самолета достаточны для его эксплуатации при волнении до двух баллов (при высоте волны до 0,5 м). Для обеспечения непотопляемости при затоплении части корпуса водой лодка и крыло самолета разделены водонепроницаемыми переборками на отсеки. Ниши шасси также герметично отделены от внутреннего корпуса лодки. Бе-103 может эксплуатироваться как на оборудованных причалом акваториях, так и на необорудованных; как автономно, так и с помощью имеющихся подручных плавсредств. Самолет может выходить из воды самостоятельно на пологий берег и спускаться в воду по отлогому спуску На стационарном, оборудованном лебедками гидроспуске с помощью тяговой лебедки производится подьем или спуск самолета за носовые буксировочные утки или за кормоиой узел. Самолет Бе-103 на воде буксируется катером с помощью специального якорного уса, подсоединяемого к буксировочным уткам. В кабине размещены предметы морского оборудования" якорь-кошка, линь с бросательным концом, багор и водозащитные рукавицы. Самолет комплектуется специальным шприцем для удаления воды из отсеков фюзеляжа.

Приборы пилотажно-навигационного и радиосвязного оборудования, пульты управлений самолетом размещены на приборной доске в кабине пилотов. Данное оборудование обеспечивает автономность при подготовке и обслуживании самолета, полеты по ППП и ПВП в ручном режиме управления, днем и ночью, в любое время года, в любых регионах мира и позволяет выполнять следующие задачи: предполетную подготовку в течение 10 мин; непрерывное определение текущих координат местоположения самолета, заданного путевого угла, бокового отклонения; ручной заход на посадку по 1-й категории ICAO; определение высоты полета, воздушной и вертикальной скорости; температуры наружного воздуха; индикацию и сигнализацию эксплуатационных ограничений и критических режимов полета.Самолет-амфибия Бе-103 оснащен пилотажно-навигационным и радиосвязным оборудованием Bendix/King.