Разработка самолета началась в 1966 г. Первый опытный самолет, оснащенный ТВД Пратт-Уит-ни Канада РТ6А-27 (2 х 715 л.с.), начал проходить летные испытания 16 апреля 1969 г.В конце 1971 г. первый серийный самолет L-41 OA поступил в эксплуатацию в чешскую авиакомпанию "Слов-Эр". Всего был построен 31 самолет. В 1973 г. начались летные испытания самолета L-410M, оснащенного чешскими ТВД Вальтер М 601А. В эксплуатацию самолет стал поступать в 1976 г. Всего фирма "Лет" построила 110 самолетов L-410M.

В 1979 г. началось производство усовершенствованной модификации L-410UVP, которая стала основной серийной моделью (построено до конца 1985г. 512 самолетов). От предшествующих вариантов этот самолет отличался удлиненным фюзеляжем, увеличенными размерами крыла и вертикального оперения, применением интерцепторов и установкой ТВД Вальтер М 601 В (2 х 730 л.с.). Этот самолет прошел программу сертификации в СССР и был принят в эксплуатацию "Аэрофлотом", став, таким образом, первым самолетом зарубежного производства, вышедшим на отечественные воздушные трассы. Дальнейшим развитием стал вариант L-41 OUVP-E с более мощными ТВД М 601 Е. Первый полет этого самолета состоялся 30 декабря 1984 г. Он отличается улучшенными взлетно-поса-дочными характеристиками и уменьшенным уровнем шума в кабине. В марте 1986 г. был сертифицирован в СССР. Разработана модификация L-420 с более мощными ТВД М601 F (2 х 778 л. с.), увеличенной взлетной массой (6,8 т) и улучшенными летными характеристиками. Летные испытания самолета начались в ноябре 1993 г.

Самолет оснащен обычным комплексом авионики совместного советско-чехословацкого производства.